Яхт-клуб «Балтиец» в течение 30 лет располагался в юго-восточной части Невской губы на Матисовом канале, вблизи устья реки Дудергофки. Это было очень удачное место для отстоя и эксплуатации катеров и яхт. В 1950-60 годы, ко времени образования клуба «Балтиец», территория, прилегающая непосредственно к Матисовому каналу, была сильно заболочена. По бокам от канала открытые водные участки простирались почти до трамвайной линии. Сам канал находился в зоне охотничьего заказника.

Еще до войны на правом берегу канала находился городской тир для стендовой стрельбы, где проводились тренировки стендовиков и соревнования различного уровня. По соседству с домиком егеря (слева от входа в яхт-клуб) располагалась мастерская по изготовлению чашек (вылетающих мишеней).

Пионеры клуба появились на Матисовом канале уже в первые послевоенные годы. После 1948 года на правом берегу канала, на месте охотничьей базы, обосновалась бригада рыбоколхоза «Прогресс», а также рыбаки-любители, охотники, заготовители камыша, браконьеры. В различных местах камышовых зарослей размещались деревянные сараи.

Общего коллектива среди владельцев челноков береговой недвижимости не было. Однако за порядком еще в конце 50-х годов следил егерь М. Лебедев, затем его сменил А. Озеров. Постепенно стоянка лодок разрасталась, пока в 1968 году ее под свой контроль не взяла государственная фирма «Невские зори».

Первое общее собрание членов стоянки состоялось в 1974 году в помещении ПТУ-106 на улице Пионерстроя. Было принято решение создать на базе лодочной станции «Невские зори» кооператив коллективных стоянок лодок, катеров индивидуальных владельцев и присвоить ему название «Балтиец». В правление кооператива вошли: В. Р. Климбек, Р. В. Ретц, А. Г. Грудинин, В. Б. Макеев. Л. В. Маркин, В. М. Мельников, Е. М. Разумихин, А. М. Юхнович, А. П. Исаев, Г. Мельних, К. Кончаловский.

27 марта 1975 года исполком Красносельского района решением №139 утвердил устав водно-моторного кооператива «Балтиец». Именно эта дата является днем рождения яхт-клуба. Кооператив развивался. Численность его участников быстро росла. В связи с отсутствием свободных мест для новых членов кооператива в январе 1976 года началось строительство второго канала, западнее первого. Канал был соединен с Матисовым каналом, длина его достигала 600 метров.

К 2000 годам началась намывка новых территорий Красносельского района, появились первые планы застройки. Клуб оказался в центре строительства жилых районов. Исполком Ленсовета принял решение №677 от 06 августа 1990 года перебазировать клуб «Балтиец» в кварталы 33а-34а – севернее ЛЭМЗ. С этой целью был выделен участок площадью 25 гектаров. Только к 2005 году при поддержке Правительства Санкт-Петербурга яхт-клуб осуществил свой переезд на новую отстроенную территорию.

Во время земляных работ на новой территории клуба «Балтиец» были найдены исторические предметы: большого размера ключ и кованый якорь. Согласно исторической экспертизе, ключ мог вполне открывать крепостные ворота, а якорь использовался на петровской галерее. Сегодня якорь выставлен на территории клуба.

1 июля 2006 года состоялось торжественное открытие новой гавани яхт-клуба «Балтиец», на котором присутствовала губернатор Санкт-Петербурга В. И. Матвиенко.

«Балтиец» объединил более 1200 участников и владельцев малого флота: яхт и катеров. В оздоровительную и досуговую жизнь клуба вовлечено более 7-8 тысяч жителей не только Красносельского района, но и города Санкт-Петербург.

В 2008 году яхт-клубу «Балтиец» присвоен Голубой флаг — международная экологическая награда за высокие стандарты качества воды на территории яхт-клуба, а также пригодность территории для безопасного купания.

На территории клуба группой энтузиастов, при поддержке администрации Красносельского района, был создан мемориал «Холм славы». В 2006 году в память о высадке первого (из пяти) морского десанта в годы Великой Отечественной войны на южное побережье Невской губы Финского залива на холме был установлен 4-х метровый деревянный крест, якоря и мемориальная доска.

В 1941 году на южное побережье Невской губы на территории от ЛЭМЗ до Петергофа были высажены морские десанты в поддержку сухопутным войскам, державшим оборону города от немецких захватчиков. 3 октября 1941 года первый десант в количестве 225 бойцов был высажен с моря на берег, занятый немецкими и норвежскими войсками, на этой территории в настоящее время располагается яхт-клуб «Балтиец». Десант состоял из матросов 6-й отдельной бригады морской пехоты, 20-й стрелковой дивизии НКВД, бойцов охраны водного района (ОВР) и ополченцев, среди которых были яхтсмены, хорошо знавшие местные условия и лоцию. 1-й десант, как и четыре следующих (с 3-го по 8 октября), выполняли задачу Ленинградского фронта по соединению 42-й и 8-й армий в районе поселка Ленино (Красносельский район) с целью активации обороны и разблокирования окруженного города. Десант был наиболее успешным, бойцы смогли дойти до улицы Штромполовки (ныне улица Чекистов) и занять Демидовский дом (1714 г.г. постройки). После боя, оставшиеся в живых отступили к заливу и в камышах ждали спасения.

В составе яхт-клуба «Балтиец» числятся участники 1-го морского десанта: Попов Владлен Николаевич, капитан I ранга в отставке, участник Великой Отечественной войны; Семенец Сергей Степанович, участник Великой Отечественной войны, а ныне полковник в отставке.

В 2016 году по новому проекту скульптора А. А. Архипова был создан гранитный монумент нового памятника. Мемориал был открыт губернатором Санкт-Петербурга А. Д. Бегловым 03 октября 2018 года на морском побережье Красносельского района, в продолжение Аллеи Славы, в честь подвига наших воинов.

На территории яхт-клуба расположен бюст Петра I Великого. Бюст был воздвигнут в 2022 году к 350-летию основателя Петербурга. Открытие состоялось в рамках 48-й навигации клуба.

Яхт-клуб «Балтиец» организует и проводит множество различных спортивных соревнований: парусные гонки, водно-моторные соревнования, буерный спорт, виндсерфинг и кайтинг, а также Чемпионаты России и Санкт-Петербурга. Клуб «Балтиец» также известен своими крупными парусными соревнованиями, такими как: соревнования на Призы Главы администрации Красносельского района СПб и «Кубок яхт-клуба «Балтиец» для крейсерских яхт.

Фестиваль «Балтийская волна», организованный яхт-клубом, включает проведение больших соревнований среди крейсерских яхт и виндсерфинга.

Регулярно проводятся важные мероприятия патриотической направленности: День победы, 9 Мая, празднование Дня рождения Балтийского флота. В честь Дня ВМФ России яхт-клуб организует традиционные гонки катеров и мотолодок.

С 2004 года на территории «Балтийца» работает «Клуб юных моряков «Навигатор», а также клуб исторической реконструкции «Морская дружина «РУС».

Важным событием для яхт-клуба и жителей района является церемония открытия и закрытия Навигации. Традиционно она проводится в память о 1-м Морском Десанте.

Активная работа клуба проводится и в сфере разработки законов и нормативных актов в сфере яхтинга и водной рекреации с профильными Комитетами.

Важным направлением работы яхт-клуба является приобщение юных жителей Красносельского района к морскому делу. В рамках этой программы клуб проводит мероприятия на базе школ.

Большим событием в жизни клуба стало открытие 12 декабря 2012 года детской парусной секции. Более 500 детей и подростков получили качественную спортивную подготовку благодаря опытному преподавательскому составу. В числе учащихся: 70 юных спортсменов и флот из 65 корпусов классов, обучающихся в разных направлениях: Луч, Луч-радиал, Луч-мини, Лазер, Лазер-радиал, Лазер 4.7, Зум, Оптимист и Олимпийский класс 470. Спортсмены успешно выступают в соревнованиях всех уровней. Воспитанники школы, уже являющиеся мастерами спорта, ведут тренерскую работу. Школа является подразделением вновь созданного городом спортивного коллектива «Олимпийские надежды».